Epidemiological aspects of influenza A related to climatic conditions during and after a pandemic period in the city of Salvador, northeastern Brazil

During the influenza pandemic of 2009, the A(H1N1)pdm09, A/H3N2 seasonal and influenza B viruses were observed to be co-circulating with other respiratory viruses. To observe the epidemiological pattern of the influenza virus between May 2009-August 2011, 467 nasopharyngeal aspirates were collected from children less than five years of age in the city of Salvador. In addition, data on weather conditions were obtained. Indirect immunofluorescence, real-time transcription reverse polymerase chain reaction (RT-PCR), and sequencing assays were performed for influenza virus detection. Of all 467 samples, 34 (7%) specimens were positive for influenza A and of these, viral characterisation identified Flu A/H3N2 in 25/34 (74%) and A(H1N1)pdm09 in 9/34 (26%). Influenza B accounted for a small proportion (0.8%) and the other respiratory viruses for 27.2% (127/467). No deaths were registered and no pattern of seasonality or expected climatic conditions could be established. These observations are important for predicting the evolution of epidemics and in implementing future anti-pandemic measures.

Parainfluenza virus infections in a tropical city: clinical and epidemiological aspects

Little information on the epidemiology and clinical characteristics of human parainfluenza virus (HPIV) infections, especially in children from tropical countries, has been published. The aim of this study was to determine the frequency of HPIV infections in children attended at a large hospital in Fortaleza in Northeast Brazil, and describe seasonal patterns, clinical and epidemiological characteristics of these infections. From January 2001 to December 2006, a total of 3070 nasopharyngeal aspirates collected from children were screened by indirect immunofluorescence for human parainfluenza viruses 1, 2, and 3 (HPIV-1, 2 and 3) and other respiratory viruses. Viral antigens were identified in 933 samples and HPIV in 117. The frequency of HPIV-3, HPIV-1 and HPIV-2 was of 83.76 percent, 11.96 percent and 4.27 percent, respectively. Only HPIV-3 showed a seasonal occurrence, with most cases observed from September to November, and with an inverse relationship to the rainy season. Most HPIV-3 infections seen in outpatients were diagnosed as upper respiratory tract infections.

Frequency of viruses associated with acute respiratory infections in children younger than five years of age at a locality of Mexico City

A locality in the district of Tlalpan, Mexico City, was selected in order to identify the viral agents in children younger than 5 years of age with acute respiratory infection (ARI). A total of 300 children were randomly selected and were included in this study for a period of 13 months. During this period nasopharyngeal exudates were collected for the isolation of viral agents. Monoclonal fluorescent antibodies were used for viral identification after cell culture. Viral infection was detected in 65 percent of the specimens. The respiratory syncytial virus (RSV) was the most common virus agent detected. Children required an average of two consultations during the study period. Two high incidence peaks were observed, one during the summer and the other during winter; the most frequent viruses during these seasons were influenza A and RSV, respectively. The largest number of viruses was isolated in the group of children between 1 and 2 years of age and in the group between 4 and 5 years of age. This study demonstrated the presence of ARI and of different viruses in a period of 13 months, as well as the most frequent viruses in children younger than 5 years of age from a community of Mexico City.

Implementación del método rápido de diagnóstico de virus por inmunofluorescencia en niños hospitalizados por infecciones respiratorias agudas / A quick viral diagnostic method by immunofluorescence in acute respiratoty illnes in hospitalized children

Las infecciones respiratorias agudas (IRA) constituyen una causa importante de morbimortalidad en pediatría donde los virus tienen un papel relevante, los cuales pueden ser diagnosticados por la inmunofluorescencia directa IFD con sensibilidad similar al aislamiento en cultivos. El objetivo del estudio fue evaluar la frecuencia de agentes virales asociados a IRA en niños internados por esta causa en diferentes hospitales del país y conocer el aspecto clínico-epidemiológico. Se realizó un estudio de corte transversal donde se analizaron por inmunofluorescencia, aspirados nasofaríngeos, secreciones traqueales, nasales, lavados bronquiales. Se estudiaron 111 muestras de enero a octubre de 1997 de niños de 15 días a 10 años identificándose un agente viral en 59 de los casos. Los agentes hallados fueron Virus Sincicial Respiratorio (VSR) 47 por ciento, el Parainfluenza 1, 2, 3 (5,4 por ciento), el Adenovirus(3,6 por ciento), el Influenza A (5,4 por ciento), Influenza B (1,8 por ciento). Los patrones clínicos fueron Bronquiolitis (49 por ciento), Neumonías (42 por ciento) y Croup (8,5 por ciento). Los VSR se identificaron con mayor frecuencia con pico en agosto; (63 por ciento) en lactantes menores. El virus de influenza A se presentó con temporalidad similar y se relacionó con casos severos en niños mayores de 5 años, en el Chaco. El Parainfluenza se observó en menores de 1 año. El Adenovirus fue más esporádico pero uno de ellos se relacionó a un caso fatal. Se observaron asociaciones de agentes virales. Con esta técnica diagnóstico útil se dispone del primer dato sobre la epidemiología de las afecciones respiratorias agudas de probable etiología viral en la población infantil del país que requirió hospitalización, siendo similar a lo observado en otros países

Evaluation of WHO monoclonal antibody kit for diagnosis of acute respiratory viral infections.

In 1990 and 1991, six laboratories located in the WHO Western Pacific Region (WPR) and South East Asian Region (SEAR) were selected, based on their experience in the immunofluorescence antibody technique (IFAT), to participate in the evaluation of a WHO monoclonal antibody (Mab) kit to detect respiratory syncytial (RS) virus, influenza A virus, influenza B virus, parainfluenza virus and adenovirus. Despite differences in the initial standardization procedures, the WHO monoclonal antibodies were found to be of high quality, sensitivity and specificity when tested on clinical specimens. The constant supply of affordable high quality reagents from WHO would enable their use in clinical virological laboratories in the developing countries as well as promote the utilization of IFAT as an adjunct to cell culture isolation in the diagnosis of acute respiratory viral infections.

Comparative evaluation of a simple and sensitive assay for detection of orthomyxo and paramyxoviruses

Studies were done to evaluate comparatively the traditional HA assay and a more recently introduced lectin-neuraminidase (LN) methodologyin search of a simple and sensitive assay for virus detection during laboratorial diagnosis. The results proved the value of LN assay as a sensitive methodologyfor detection of virus particles, presenting results at least equal to those obtained by HA (hemagglutination) assay, with significant values of accumulated frequencies for LN/HA factors (ratios between LN and HA titers) higher than two. The accumulated values of frequencies for LN/HA factors as high as four were very significant, 72.7 (per cent) for influenzavirus and 60.7 (per cent) for Newcastle disease virus (NDV), moreover accumulated frequencies for LN/HA factors even as high as 32 were due to influenzavirus (45.4 per cent) and NDV (7.2 per cent) samples. After the storage period, most of those concentraded samples that even did not present HA titers could be detected through LN assay, demonstrating a lower threshold for virus detection

Detección de antígenos virales en lactantes con infección respiratoria aguda baja / Viral antigens in nasopharingeal exudates from infants with acute lower respiratory tract infections

Con el propósito de medir la frecuencia con que se aíslan determinados antígenos virales, en niños con infecciones respiratorias agudas bajas graves (IRAB), se realizaron ensayos de inmunofluorescencia (IF) para antígenos de virus sincicial respiratorio (VSR), adenovirus (ADV), virus parainfluenza 1, 2 y 3 (VPI), virus influenza a y b (VIa y VIb) en las secreciones nasofaríngeas de 660 niños menores de 24 meses que cumplían con criterios clínicos y radiológicos de IRAB grave comúnmente aceptados. En 322 casos (48,8%) se obtubvieron resultados positivos. Los antígenos más frecuentemente identificados fueron los de VSR (56,2%) y ADV (26,7%). La letalidad en niños con IRAB e IF positiva fue 9,9% y 6,2% en aquellos con IF negativa (p NS). En 24 de 32 (75%) pacientes fallecidos con IF positivas, el antígeno identificado correspondía a ADV, siendo el riesgo de morir en estos casos significativamente mayor que en el de pacientes portadores de otros antígenos o ninguno (Z crítico -1,65. Z calculado -1,178). La apnea fue la principal manifestación clínica en 46 pacientes, todos menores de 3 meses y 19 con reacciones de inmunofluorescencia positivas que, con una sola excepción, correspondían a antígenos de VSR

Infección respiratoria aguda baja; IRAB, en lactantes hospitalizados: aplicación de técnicas rápidas de diagnóstico etiológico / Acute lower respiratory infections; ALRI in hospitalized infants: use of rapid techniques for etiological diagnosis

Las IRAB representan, en el período del lactante, una causa importante de morbilidad, hospitalización y mortalidad, siendo los virus sus principales agentes etiológicos. Por clínica es difícil precisar etiología, siendo tratados con antibióticos. Se estudiaron en 1988, en forma prospectiva, 97 lactantes, menores de 2 años, portadores de IRAB, diagnosticada clínica y radiológicamente, con menos de 6 días de evolución. Se tomó radiografía de tórax y se investigó etiología viral mediante IF y aislamiento. Se comprobó que esta afección predomina en los lactantes menores de 1 año, principalmente durante los meses fríos y que el VRS es el más frecuente (45,5%) en casi todos los meses, con un máximo entre julio y agosto. El rendimiento de la IF es excelente para el VRS, Parainfluenza 3 e Influenza A. Pero el hallazgo de Adenovirus se duplica al agregar el aislamiento (p=<0.05). El costo de la IF es bajo y se fundamentaría en 52,6% de los pacientes la posibilidad de no dejar o de suspender el tratamiento antibiótico. Este hecho significaría: 1) Disminuir los días de hospitalización; 2) Menos agresiones al niño; 3) Ahorro de insumos; 4) Prevenir infecciones intrahospitalarias y 5) Ahorro de trabajo al personal de enfermería

Infecciones respiratorias agudas intrahospitalarias / Hospital acute respiratory infections

Se estudiaron 31 lactantes ingresados entre mayo y agosto de 1988 a una sala índice del Servicio de Pediatría, Hospital San Juan de Dios, Santiago de Chile, con diagnóstico de IRA baja, con el propósito de conocer la incidencia de la infección nosocomial respiratoria en la primera semana de hospitalización. En cada niño se realizó estudio virológico y bacteriológico seriado. En 13 de los 31 pacientes se detectó uno o más agentes virales nuevos en la segunda muestra (18 nuevos aislamientos en total), los que podrían haber sido adquiridos durante la hospitalización; los segundos virus fueron: Ad (n = 8), VRS (n = 5) y CMV (n = 5). No se detectaron cambios significativos de la flora bacteriana en el período estudiado

Estudio etiológico de enfermedades en vias respiratorias de niños / Etiologic study of respiratory tract diseases in children

"De Diciembre de 1982 a Marzo de 1983 fueron estudiados 401 niños menores de 6 años en la ciudad de La Ceiba, Honduras: 226 niños con síntomas de vías respiratorias y un grupo control (asintomático) de 175 niños. Se determinó la incidencia y prevalencia de diferentes tipos de virus y bacterias en la población estudiada, mediante aislamiento de antígenos y/o detección de anticuerpos séricos. Se obtuvo una incidencia de un 6l,06% de los pacientes estudiados con enfermedad respiratoria de etiología viral, ocupando el primer lugar el Virus Sincitial Respiratorio (RSV) con un 27,13% y en segundo lugar el Parainfuenza Virus (Para Flu) con un 22,19%. Otros virus fueron identificados en menor porcentaje. Se obtuvo una prevalencia de un 91,27% de pacientes con enfermedad respiratoria de etiología viral en la población estudiada. Tambiém aquí el virus más frecuentemente diagnosticado fue el RSV (70,07%). No se encontró gran diferencia en la distribución viral según nivel socio-económico ni sexo. También se detectaron anticuerpos séricos para el Mycoplasma pneumoniae en un 5,48% de los pacientes estudiados, para el Haemophilus Influenzae tipo b (H. flu b) en un 0,99%, para Chlamydiae en un 3,99% y para el Streptococcus pneumoniae 93 (Sp 93) en 1,99% de los pacientes, mostrando relativamente una mayor incidencia entre el grupo de niños en edad pre-escolar (2 a 6 años)

Viruses and bacteria associated with acute respiratory illnesses in young children in general practice.

The results obtained and the laboratory methods used for the isolation of viruses and bacteria from Malaysian children with acute respiratory illnesses seen in a private clinic are described. Of the 65 children studied virus isolations were obtained from 26 children, bacteria from 10 and both virus and bacteria from another 5. The agents isolated were influenza viruses, parainfluenza viruses, adenoviruses, Bordetella pertussis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae and Staphylococcus pyogenes.